蛋仔派对作为一款拥有海量皮肤的休闲竞技手游，部分限量或早期赛季的皮肤因获取难度极高而成为玩家群体中公认的珍稀藏品。根据游戏内数据和玩家社区反馈，S1赛季的至臻皮肤艾瑞和巴蒂因其上线时间早、获取渠道有限，目前全服持有率不足0.3%，成为当之无愧的顶级稀有皮肤。该皮肤采用复古机车造型设计，角色动作带有专属粒子特效，在竞技场滚动时会遗留火焰轨迹，其视觉辨识度与收藏价值均属游戏天花板级别。
另一款备受追捧的稀有皮肤是S1赛季盲盒隐藏款透明蓝帽，其稀有性源于极低的抽中概率和未开放保底机制。该皮肤采用半透明材质与动态流体效果，帽檐会随移动产生水波纹晃动，据官方历史公告显示其原始抽取概率仅为0.07%。部分早期联动皮肤如长草颜团子虽曾返场，但初代版本因细节差异仍被资深玩家视为更具收藏价值，这类皮肤的市场流通量往往受限于特定活动周期。
游戏内测阶段专属的小虎套装因其获取途径的特殊性占据稀有皮肤第三席位。该套装包含全套虎纹服饰与动态尾巴配件，仅向参与2022年技术测试的玩家发放，且未在正式服开放复刻渠道。拥有完整小虎套装的活跃账号占比不足万分之一，其稀有度随着时间推移持续攀升。同样具有时代特征的还有首款节日限定皮肤雪怪毛毛，该皮肤需通过现已下架的挑战模式达成特定分数解锁，其复杂的获取条件导致现存保有量极为有限。
在联动类皮肤中，DongDong羊双生皮肤因保底机制要求2400蛋币/只的抽取成本，成为氪金类皮肤中的稀缺代表。该系列皮肤采用双形态切换设计，常规状态下呈现绵羊造型，使用技能时会触发天使光环特效。根据2024年消费数同时拥有两款DongDong羊皮肤的玩家仅占全体用户的1.2%。而三丽鸥联动的大耳狗皮肤虽保底价相同，但因活动持续时间更长，稀有度相对略低。
超燃竞技场限定的小蓝与小绿作为免费皮肤中的稀有款，凭借独特机制脱颖而出。小蓝拥有大天使同款悬浮特效，小绿则具备专属载具系统，这两款皮肤仅可通过2025年3月版本限时活动获取，且未列入常规返场计划。部分赛季隐藏款如S10的洛洛飞船皮肤，其抽取概率未公开但社区反馈获取难度极高，这类皮肤往往在赛季结束后价值显著提升。
